Ученые из Университета Британской Колумбии обнаружили “слабое место” во всех основных вариантах вируса SARS-CoV-2, сообщает Nature Communications. Эта уязвимость, также наблюдавшаяся в недавно разработанных подвариантах омикрон BA.1 и BA.2, является структурным компонентом вируса, который «в значительной степени не меняется во всех вариантах и может быть легко нейтрализован фрагментом антитела». – Перед нами открылись совершенно новые возможности лечения, – сказал доктор Шрирам Субраманиам, руководитель исследовательской группы.
Эту слабость потенциально можно использовать путем нейтрализации антител, прокладывая путь для лечения, эффективного против всех вариантов коронавируса. Команда под руководством Dr. Шрирама Субраманиама использовал криоэлектронную микроскопию (КРИО-ЭМ), чтобы выявить на атомном уровне структуру чувствительного участка белка вирусного шипа. Этот фрагмент называют эпитопом. Тогда же ученые описали антитело VH Ab6, фрагмент которого способен прикрепляться к эпитопу вируса и полностью его нейтрализовать.
SARS-CoV-2 — это высокоадаптивный вирус, который эволюционировал во избежание большинства существующих методов лечения антителами, а также большей части иммунитета, обеспечивающего вакцины и природные инфекции, сказал доктор Субраманиам. “Наше исследование выявило слабость, которая практически не меняется во всех вариантах и может быть легко нейтрализована фрагментом антитела”, – добавил он.
«Это хорошая основа для разработки различных терапий и методов лечения, которые могут помочь многим людям из группы риска», — подчеркнул он.
“Перед нами открылись совершенно новые возможности лечения”
Антитела — это молекулы, которые естественным образом производит наш организм для борьбы с инфекцией, но их можно выработать в лаборатории и предоставить пациентам позже. Хотя уже разработано несколько методов лечения антителами против COVID-19, их эффективность всегда резко снижалась перед лицом новых, сильно мутированных вариантов, таких как омикрон.
– Антитела присоединяются к вирусу очень специфическим образом. Подгоняют его как ключ к замку. Итак, когда вирус мутирует, ключ больше не совпадает, объяснил Субраманиам. – Так что мы искали универсальные ключи. Антитела, нейтрализующие вирус даже после больших мутаций, добавил он.
Таким универсальным ключом, идентифицированным в описанном исследовании, оказался фрагмент антитела VH Ab6. Эксперименты подтвердили его эффективность против вариантов альфа, бета, гамма, дельта, каппа, эпсилона и омикрона. Фрагмент нейтрализует SARS-CoV-2, присоединяясь к эпитопу спаечного белка и блокируя вирус проникновения в клетки человека.
– Эпитоп, который мы описываем в этой публикации, не охватывается т.н. горячих точек мутации, поэтому он сохраняется в очень похожем или неизменном виде в разных вариантах, – сказал автор исследования. – Теперь, когда нам удалось подробно описать его структуру, перед нами открылись совершенно новые возможности лечения, – подчеркнул он.
“Ахиллесова пята” коронавируса
По словам доктора Субраманиам, эта специфическая «ахиллесова пята» вируса может быть использована производителями лекарств не только для создания эффективных мер против доминирующих сейчас вариантов, но и тех, которые появятся через некоторое время.
– Мы получили полную картину этого чуткого места. Мы знаем каждое взаимодействие спаечного белка с антителом в этой же области. Таким образом, мы можем разработать массу различных методов лечения антителами, подытожил Субраманиам. «И наличие широко эффективных, многовариантных препаратов полностью изменило правила игры в условиях пандемии», — добавил он.
Основной источник фото: Shutterstock